Workshop Jana2006
pořádaný v rámci Kolokvia Krystalografické společnosti v Hluboké nad Vltavou 22.6.-25.6.2009
Stránka kolokvia: www.xray.cz/xray/csca/kol2009/
Stránka programu: www-xray.fzu.cz/jana
Jana2006 je program pro krystalografické výpočty, který je vyvíjen od začátku 80. let ve Fyzikálním ústavu AVČR. Pokrývá široký okruh problémů od jednoduchých trojrozměrných struktur až po modulované krystaly a magnetické struktury. Struktury lze upřesňovat proti monokrystalovým i práškovým datům z rentgenových, synchrotronových nebo neutronových zdrojů, data lze libovolně kombinovat. Z množství aplikací jsme pro workshop vybrali několik typických příkladů, které budou probrány v jednotlivých blocích.
Počítačové a programové vybavení
Laptop s operačním systémem Windows2000/XP/Vista. Pozor - verze Jana2006 pro UNIX ještě není k dispozici!
Materiály pro účastníky workshopu
Každý dostane instalační soubor s nejnovější verzí programu Jana2006 a instalací demo verze kreslícího programu Diamond. Kdo se chce vyhnout používání této demo verze, může si přinést jakýkoli kreslící program, který dokáže načíst CIF na příkazové řádce, protože takové programy dokáže Jana2006 přímo volat. Uživatele programu ATOMS upozorňujeme, že komunikace přes CIF a příkazovou řádku bývá provázena problémy. Dále účastnící obdrží data k příkladům a anglicky psanou kuchařku s podrobným popisem řešení.
Prosíme účastníky, aby nepoužívali jinou verzi programu, než LATEST z neděle večer 21.6. Nejlepší je počkat s instalací respektive reinstalací na workshop.
Organizace workshopu
Workshop bude rozdělen na tématické bloky. Počet bloků bude upřesněn podle zájmu. Každý blok se bude skládat z přednášky ukazující principy řešení a z praktické části, kdy by se účastníci měli pokusit s pomocí kuchařky o řešení problému na svých laptopech. Praktická část v prvním bloku bude zahájena instalací a konfigurací programu.
Finální program workshopu
Omlouváme se zájemcům o upřesňování z práškových difrakčních dat, ale tuto tématiku jsme z časových důvodů nakonec vypustili. Důvod, proč právě prášky, je ten, že veškeré postupy následující po upřesnění profilových parametrů jsou shodné s monokrystaly a používají stejné nástroje. Krok k práškům je velmi jednoduchý pro toho, kdo umí používat Janu2006 na monokrystalových datech.
1. Pondělí večer (60 min)
Přednáška na téma Co umí Jana2006 (20 min)
Instalace programu Jana2006 a Diamond (20 min)
Stanovení velmi jednoduché organokovové struktury podle velmi podrobné kuchařky (20 min)
2. Úterý večer (60 min)
Řešení organické struktury s pseudomeroedrickým dvojčatěním podle pořád velmi podrobné kuchařky. Předcházet bude krátká přednáška s úvodem do problematiky.
3. Středa odpoledne (2 až 3 hodiny)
Řešení organokovové struktury se složitým disorderem. Budou se štípat atomové polohy a zavádět rigid body. Předcházet bude krátká přednáška s úvodem do problematiky. Ti, kdo se zajímají o upřesňování mixovaných poloh, zde naleznou všechno potřebné, ačkoli struktura mixované polohy neobsahuje.
4. Čtvrtek odpoledne (2 až 3 hodiny)
V tomto bloku budou předvedeno řešení jednoduché modulované struktury. Předcházet bude přednáška, která by měla nenáročnou formou vysvětlit, co jsou modulované struktury, co se upřesňuje a jak se prezentují výsledky.
Všechny bloky jsou otevřené i pro ty, kteří se na ně nehlásili. Přihlašováním jsme pouze zjišťovali zájem o témata. Na shledanou v pondělí!!!!